Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX2P28328 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX2P28328 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX2P28328 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms