Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USF1P22415 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USF1P22415 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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