Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTRB1P17538 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms