Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms