Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TPRP12270 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TPRP12270 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TPRP12270 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TPRP12270 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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