Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPREB1P12018 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms