Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
APELAP0DMC3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms