Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF888P0CJ79 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms