Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERPIND1P05546 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms