Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT6BP04259 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms