Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IGHV3-33P01772 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms