Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDELR3O43731 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDELR3O43731 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms