Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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