Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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