Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GOLGA6L9A6NEM1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA6L9A6NEM1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms