Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POMPQ9Y244 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POMPQ9Y244 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms