Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms