Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX7Q9UNH6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms