Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIMKLBQ9ULI2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms