Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DKK3Q9UBP4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms