Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms