Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTLNQ9NXG0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTLNQ9NXG0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms