Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms