Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM55Q9BYV6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms