Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms