Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSDMCQ9BYG8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms