Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms