Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms