Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIRIP3Q9BW71 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms