Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTA3Q9BTC8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms