Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SEC22CQ9BRL7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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