Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TREX2Q9BQ50 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms