Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms