Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SORT1Q99523 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms