Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms