Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms