Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECHDC3Q96DC8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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