Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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