Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRG4Q92954 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms