Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

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Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZFP28Q8NHY6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZFP28Q8NHY6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZFP28Q8NHY6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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