Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SETD9Q8NE22 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms