Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM35BQ8NCS4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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