Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGDCC3Q8IVU1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms