Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RAB11FIP4Q86YS3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RAB11FIP4Q86YS3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RAB11FIP4Q86YS3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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