Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms