Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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LINC00299Q6ZSB3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00299Q6ZSB3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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