Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC141Q6ZP82 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms