Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms