Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms