Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms